🔬 ToxinPred3.0이란?

2025년 08월 21일

ToxinPred3.0 독성 예측 펩타이드 단백질 머신러닝 toxicity prediction peptide protein 바이오안전성

ToxinPred3.0은 단백질 및 펩타이드 서열의 독성 가능성을 예측하는 머신러닝 기반 도구입니다. 세포막 파괴 가능성에 기반한 독성 예측 외에도 다양한 독성 분석 모듈과 연계 활용이 가능합니다.

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ToxinPred3.0 은 단백질 또는 펩타이드 서열의 잠재적인 독성 여부를 예측 하는 머신러닝 기반 도구입니다. 독성/비독성 펩타이드 DB 를 기반으로 학습되어, 사용자가 입력한 새로운 서열에 대해 세포막 파괴 가능성 중심의 일반 독성 여부 를 판단합니다.

참고: 내부적으로 Global sequence 패턴과 Local motif 정보를 활용한 복합적 예측이 가능합니다.

🧪 우리 플랫폼에서 어떻게 제공되나요?

우리 플랫폼에서는 ToxinPred3.0을 직관적인 UI로 제공합니다. 복잡한 파라미터 설정 없이, FASTA 입력 또는 파일 업로드만으로 단일 또는 다중 서열의 독성 예측 을 수행할 수 있습니다.

옵션	설명
ML	서열의 Global 패턴 기반 예측 (빠름)
MERCI	Local motif 기반 예측 (정밀)
Hybrid	Global + Local 통합 예측 (가장 정확)
Region importance	독성에 기여하는 서열 영역 시각화

📝 사용 방법 안내

1. 작업 이름 지정

분석 결과를 구분하기 위한 작업 이름을 입력합니다.

2. 입력 방식 선택

• FASTA 서열 직접 입력
• FASTA 파일 업로드

3. 파라미터 설정

• ML, MERCI, Hybrid 중 선택
• Region importance 옵션 선택 가능

4. 결과 확인

출력 결과에는 다음과 같은 지표가 포함됩니다:

지표	설명
ML score	1에 가까울수록 toxic 가능성 높음 (절대적인 독성 강도 의미는 아님)
MERCI score pos/neg	motif 유사성 기반 toxic/non-toxic 유사도
Hybrid score	ML + MERCI 통합 점수
Prediction	최종 독성 여부 예측 (0.5 기준)
PPV	예측이 positive일 때 실제 독성일 확률

Job Name: toxin_test01
입력값 예시:
>peptide1
WKWLKKLFK

🧬 분석 결과 활용 예시

ToxinPred3.0은 다음과 같은 연구 및 개발 분야에서 유용하게 활용됩니다:

• 항균/항바이러스/항암 펩타이드의 독성 사전 평가
• 펩타이드 백신 후보의 안전성 검증
• 식품 유래 펩타이드의 소비자 안전성 확인
• 나노바이오소재의 세포 독성 예측

⚠️ 주의사항

• 입력은 FASTA 형식 으로 해야 하며, 너무 긴 서열은 처리 시간이 증가할 수 있습니다.
• Hybrid 모드 는 정확하지만 분석 시간이 더 소요됩니다.
• score 값이 높다고 독성이 더 강하다는 의미는 아닙니다. binary classification 기준입니다.
• 다중 서열 입력 시, 분석 결과를 엑셀로 다운로드할 수 있습니다.

✅ 마무리

ToxinPred3.0은 다양한 생명과학/의약 연구에서 안전성 평가의 필수 도구 로 활용될 수 있습니다. 특히 다른 예측 모듈이나 설계 도구와 연계해 독성 없는 펩타이드 설계 로까지 확장할 수 있습니다.

지금 바로 ToxinPred3.0 분석 페이지에서 직접 사용해보세요!

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📌 관련 독성 예측 도구들도 함께 살펴보세요:

• 간 독성: DILI
• 심장 독성: hERG-prediction
• 신경 독성: NeuTox
• 유전 독성: Amesformer
• 면역 독성: mhcflurry, DeepNeo
• 구조 기반 독성 예측: StrucToxNet, tAMPER, HEMOPI2

🧩 연계 도구 예시: Boltz, ThermoMPNN, ProteinMPNN